Gulbinėnų dvaro savininkas, generolas Kazys Ladyga (1893–1941) dvaro rūmuose 1936 m. įrengė koplyčią. 1939 m. pabaigoje įkurta parapija. Po Antrojo pasaulinio karo dvaro rūmai su koplyčia nacionalizuoti. Dabartinė bažnyčia įrengta mūriniame ūkiniame pastate 1948 m. Ji stačiakampio plano. Ant kraigo pastatytas bokštelis. Šventoriaus tvora metalinė. Šventovėje yra du varpai. Bokšte pakabintas paprastas nedidelis varpas (ø 35 cm). Bažnyčioje saugomas varpas (ø 32 cm), atvežtas iš netoliese esančios Motiejūnų kaimo kapinių koplyčios. Įdomu, kad Gulbinėnų bažnyčios prižiūrėtojais, taip pat ir varpininkais, tarnavo trys Šatų šeimos kartos: tėvas Edvardas, sūnus Aloyzas ir anūkas Jonas.