1516 m. Žygimantas Senasis dovanojo Kapočiui, savo raštininkui, Pervalko valdytojui, dalį girios su gyvenvietėmis – taip įsikūrė Kapčiamiestis. Vėliau Kapčiamiestis ir aplinkiniai dvarai atiteko Mikalojui Oginskiui, kuris 1724 m. pastatydino Kapčiamiestyje medinę bažnyčią. Parapijos teises Kapčiamiesčiui suteikė Vilniaus vyskupas J. Masalskis. 1824 m. Oginskiai pastatydino dabartinę bažnyčią.