Kauno rajono muziejus sukurtas sujungus keturis Kauno rajone esančius muziejus ir amatų centrą: Juozo Naujalio memorialinį muziejų su filialu Biliūnų kaime, Antano ir Jono Juškų etninės kultūros muziejų Vilkijoje, Babtų kraštotyros muziejų ir Tado Ivanausko Obelynės sodybą. Naujas muziejus kuria glaudžius ryšius su praeitimi ir dabartimi, kaupia, tiria ir eksponuoja Kauno krašto kultūros istoriją atspindinčius muziejinių vertybių rinkinius. Muziejaus rinkiniuose – daugiau kaip 3000 muziejinių vertybių. Gausiausią rinkinio dalį sudaro kompozitoriaus Juozo Naujalio (1869–1934) gyvenimą, kūrybą, visuomeninę veiklą atspindintys eksponatai. Tai fotografijos, dokumentai, asmeniniai daiktai, muzikiniai kūriniai. Kitą rinkinio dalį sudaro Raudondvario, jo apylinkių, čia gyvenusių žymių žmonių gyvenimo istoriją liudijantys eksponatai, Kauno krašto etnokultūros kolekcija.

Kauno rajono muziejuje rodomas stiklo menininkų Audriaus Vaišnio ir Agnės Danelevičiūtės-Vaišnienės sukurtas ir Kauno rajono muziejui padovanotas unikalus meno kūrinys "Stiklo kambarys". Modernus meno kūrinys – instaliacija, pagamintas iš lakštinio įvairių storių nešlifuoto stiklo, sluoksniuojant atitinkamos formos ir dydžio plokšteles. Kompoziciją sudaro fotelis, toršeras, indais ir valgiais padengtas valgomasis stalas, kėdės su atlošais ir žaislas.