Pirmoji medinė bažnyčia pastatyta 1750 m, o 1893 m. ji sudegė. 1906 m. pašventinti būsimos mūrinės Pajūralio bažnyčios pamatai. 1908 m. pašventino Plungės klebonas Vincentas Jarulaitis, vėliau buvo konsekruota paskutinio Žemaičių vyskupo Pranciškaus Karevičiaus.

Bažnyčia vienanavė su vienu bokštu priekyje. Jos šonuose pristatytos dvi zakristijos. Presbiterijos akcentas – šv. Joakimo altorius. Jo kompozicija – tai modifikuotas italų manierizmo portalas, kuris puošyboje jungia įvairius praeities stilius nuo viduramžio iki baroko. Altoriaus archtektūrą papildo tapyba ir skulptūra. Centrinio protarpsnio nišą puošia romantinis šv. Joakimo paveikslas. Monumentalizuota figūra kairėje sulenktoje rankoje laiko pintinėlę su 2 balandžiais, dešiniosios gestas nukreiptas į dangų. Paveikslas tapytas A. Pžeslanskio 1912 m. Šoniniai altoriai irgi eklektiniai, tik kuklesnių formų. Kompozicijos remiasi portalų pavyzdžiais ir užbaigia trikampiais frontonais. Kairįjį altorių puošia Aušros vartų Marijos kopija, o dešinįjį – šv. Jono Nepomuko paveikslas.