Mindaugo krikšto metu ir iki jo mirties (1250-1263 m.) pranciškonai jau nuolatos gyveno Lietuvoje. Vertingų vienuolyno architektūros fragmentų, ankstesnių už XVIII a., išliko nedaug, bažnyčios - kiek daugiau. Pranciškonų ansamblis - tikras miesto architektūros istorijos metraštis. Jis užima vieną didžiausių Senamiesčio plotų šalia senosios Trakų gatvės.