Akmenės krašto muziejuje saugoma ir eksponuojama vieno žinomiausių Lietuvoje dieninių drugių kolekcionieriaus Boriso Izenbeko (1910-2006) kolekcija. Lietuvos zoologas, biomedicinos mokslų daktaras Povilas Ivinskis teigė, kad saugoma kolekcija yra didžiausia dieninių drugių kolekcija Lietuvoje. B. Izenbeko kolekcijoje yra apie 5000 dieninių drugių iš viso pasaulio (ekspozicijoje šiuo metu – arti 2000). Keliolika kolekcijoje esančių eksponatų rūšių yra ant išnykimo ribos ir dabar pasaulyje griežtai saugomi.
Akmenės muziejuje taip pat nuolat veikia fosilijų ir tautodailės ekspozicijos.