Šaltiniuose nurodoma, kad Klaišių dvarą XIX a. I p. - XX a. pr. valdė Burbos. Dvarininkas Feliksas Burba devyniolikto šimtmečio viduryje čia pastatė spirito varyklą, keletą kitų ūkinių pastatų. Po Pirmojo pasaulinio karo dvaro pastatai ir dalis žemės buvo išdraskyti gabalais, pardavinėjami. 1925-1941 m. dvaro savininku tapo Vincas Karvelis. 1941 m. Karvelių šeima sovietinės okupacinės valdžios ištremta. Po II pasaulinio karo spirito varyklos pastato vidus perstatytas ir pritaikytas kolūkio kontorai bei kultūros įstaigoms. Sunykus kolūkiams, pastatai liko nenaudojami ir netvarkomi.