1775 m. Ukmergės apskrities dūmų surašymo suvestinėje minimas Kraštų palivarkas, priklausantis Obelių parapijai. Dabartinius dvaro rūmus pastatė Juozas Tupalskis 1892 m. J. Tupalskis šalia rūmų įkūrė parką, sodą. Po jo mirties 1904 m. dvarą paveldėjo pusbroliai Juozas ir Edvardas Tupalskiai. Dvaro rūmuose nuo 1923 iki 1966 m. veikė mokykla. Mokykla užėmė didįjį kambarį, buvo nuomojamas butas mokytojui. Tarpukariu dvaro rūsyje buvo įrengta pieninė. 1946 m. ji iškelta, rūmuose liko tik pieno supirkimo punktas. 1940 m. dvaras nacionalizuotas. Juozo Tupalskio šeima pasitraukė į Lenkiją, Edvardo Tupalskio šeima 1948 m. buvo ištremta į Sibirą. 1949 m. rūmuose įsteigta kolūkio kontora, parduotuvė, kolūkiui atiteko pieno supirkimo punktas. Apie 1966 m. kolūkio kontora išsikėlė, pastatas stovėjo neremontuojamas. 1990 m. dvarą atgavo Tupalskiai, vėliau jį pardavė.

Šiuo metu Kraštų dvaras priklauso privačiam asmeniui ir yra restauruojamas.