Laisvės kovų muziejus pradėtas kurti visuomeniniais pagrindais 1992 m. Lazdijų rajono tremtinių, partizanų, politinių kalinių ir jų artimųjų iniciatyva. Ekspozicija įrengta name, kuriame pokario metais buvo įsikūrusi Valstybinio saugumo Lazdijų būstinė (KGB). Eksponatus dovanojo Lazdijų rajono gyventojai ar kitaip su mūsų kraštu susiję asmenys. Muziejaus įkūrėjai buvo J. Sandienė, J. Verseckas, L. Viršila, Z. Urbonaitė bei kiti Lazdijų politiniai kaliniai ir tremtiniai, Sąjūdžio dalyviai.
1994 m. kovo 4 d. muziejus atidarytas kaip Lazdijų rajono savivaldybės administracijos Kultūros skyriaus Laisvės kovų muziejus "Kraujo takais". 2004 m. muziejus prijungtas prie Lazdijų krašto muziejaus. Muziejuje surinkti politinių kalinių, tremtinių, partizanų, jų ryšininkų, kitų gyventojų prisiminimai, daiktiniai liudijimai apie 1944–1953 m. laisvės kovas bei Lazdijų krašto gyventojų trėmimo ir įkalinimo etapus.
Laisvės kovas Dainavos apygardos Šarūno rinktinėje sovietų okupacijos metais atspindi inovatyvi ekspozicija, kurioje surinkta medžiaga apie Lazdijų krašto kovotojus, jų atminimo įamžinimo vietas. Ekspozicijoje skirtoje Legendiniam Lietuvos partizanų vadui Adolfui Ramanauskui-Vanagui – medžiaga, dokumentai, nuotraukos, knygos, liudijančios jo didvyrišką auką Lietuvos vardan. Tremtinių buities ekspozicijoje yra tremtinių naudoti daiktai, to laikotarpio dokumentai, nuotraukos, atsiminimai, garso ir vaizdo medžiaga. Ekspozicijoje "Lazdijiečiai Sąjūdyje ir Baltijos kelyje" pasakojama apie Atgimimo ir Lietuvos nepriklausomybės atkūrimo įvykius. Daugelio dėmesio sulaukia Lazdijų pasienio rinktinės dovanos muziejui: atminimo medaliai, suvenyrai, padėkos.
Muziejuje vyksta edukaciniai užsiėmimai partizaninių kovų ir tremties istorijos temomis. Čia galima rengti istorijos pamokas, seminarus, įvairius renginius.