Metodistų bendruomenė Kaune įsikūrė apie 1900 m., kai grupė žmonių pradėjo reguliariai rinktis maldai ir Šventojo Rašto studijoms. 1910 m. buvo pastatyta bažnyčia. Po Lietuvos okupacijos bažnyčia 1944 m. buvo konfiskuota ir uždaryta. Atsikūrė 1995 m.