Kėdainių sinagogų kompleksą sudaro dvi sinagogos - mažoji (žieminė) ir didžioji (vasarinė). Abi sinagogos pastatytos dar XIX a. Mažoji sinagoga buvo pastatyta 1837 m., kurios eksterjere matyti istorizmo architektūros bruožai. Nuo 2002 m. sinagogoje veikia daugiakultūrinis centras, kuriame galima susipažinti su Kėdainių žydų bendruomenės istorija ir organizuojami įvairūs kultūriniai renginiai.

Didžioji (vasarinė) sinagoga pastatyta dar 1784 m. vietoje prieš tai sudegusios medinės sinagogos, kurioje trumpai mokėsi ir pats  Vilniaus Gaonas. Priešais Didžiąją sinagogą buvusiame pastate, vietinių vadintame "skerdiko namu", buvo įrengta mėsinė. Dalis šio pastato buvo naudojama ir kaip areštinė. "Skerdiko namą" ir žieminę sinagogą kadaise jungė arka, kurioje buvo įtaisytas saulės laikrodis su hebrajiškomis raidėmis vietoje skaičių. Panašių laikrodžių būta ir kitų Europos miestų žydų kvartaluose. Sovietmečiu sinagoga stipriai nukentėjo, buvo perstatyta vidinė pastato struktūra. Dabar restauruotoje sinagogoje įsikūrusi Kėdainių dailės mokykla.

Dviejų ar daugiau sinagogų kompleksų Lietuvoje yra išlikę tik Joniškyje, Kėdainiuose ir Kalvarijoje.