Šešupės slėnyje prie Varpo gatvės 1941 m. buvo nužudyta ir palaidota apie 5090 žydų ir kitų tautybių žmonių.

1941-06-22 prasidėjo Vokietijos ir Sovietų Sąjungos karas. 1941-07-07 Marijampolėje buvo nužudyti pirmieji 32 marijampoliečiai žydai, o tą pačią liepos 18 d. miriop pasiųsti dar 53 juidaizmą išpažįstantys asmenys ir tai buvo tik pradžia. 1941-09-01 kareivinių šaudyklos teritorijoje buvo nužudyta virš šešių tūkstančių žmonių, tarp kurių buvo beveik visi marijampoliečiai žydai. Šias žudynes vykdė Joachimo Hammanno "skrajojantis būrys", kurio pagrindą sudarė lietuviškasis Tautos darbo apsaugos batalionas, o tiksliau 3–oji kuopa. Marijampolėje žydų žudynės vyko praktiškai miesto teritorijoje, todėl šūvius ir aukų klyksmą girdėjo visa Marijampolė.

Tarybiniais metais masinė kapavietė buvo kareivinių teritorijoje, todėl patekti ten buvo galima tik su Sovietinės kariuomenės leidimais. Vykstant parodomiesiems aukų pagerbimams buvo kalbama tik apie tarybinius piliečius, kurie čia buvo sušaudyti, tačiau niekada neminimos tikros aukos – marijampoliečiai žydai, kurie buvo reikšmingais miesto kūrėjais.