Šaukoto katalikų bažnyčią, tuomet vadintą koplyčia, savo lėšomis 1767 m. pradėjo statyti Kalnuotojo Šaukoto dvaro savininkas Simonas Petras Herubavičius. Bažnyčios statyba pabaigta 1795 m. Žinoma, kad ji XIX a. I pusėje rekonstruota ir padidinta, vėliau kelis kartus remontuota. Bažnyčia medinė, liaudies architektūros formų, stačiakampio plano, su zakristija prie šono ir penkiasiene apside. Šventoriuje stovi medinė varpinė (XVIII a.).