1845 m. įkurta Veprių parapija. Dabartinė mūrinė Rožinio Švč. Mergelės Marijos parapijos bažnyčia Veprių miestelio centre, Veprių ežero šiauriniame krante ant nedidelės pakilumos pastatyta 1909–1910 m. Jos statytojas – kunigas Teofilis Vasiliauskas (mirė 1918 m., palaidotas bažnyčios šventoriuje). Pagrindinis fundatorius – grafas Marijonas Broel Pliateris, architektas – V. Stipulkovskis. 1944 metų liepos 24 dieną besitraukdama vokiečių kariuomenė susprogdino Veprių bažnyčios varpinės bokštą, kuris buvo maždaug 40 metrų aukščio. Suremontuota pagal 1947 m. projektą.