Upytės Šv. Karolio Boromėjaus medinė bažnyčia pastatyta 1878 m. klebono Felicijono Bytauto ir parapijiečių iniciatyva. Liaudies architektūros formų pastatas turi neobaroko bruožų, yra stačiakampio plano, vienanavis, su trisiene apside ir dviem bokšteliais. Bažnyčios viduje įrengti trys altoriai, aštuonių registrų vargonai. Didįjį altorių, puoštą skulptūromis, paveikslais ir drožybos elementais, sukūrė meistras Jonas Danauskas. Vienaaukščius šoninius altorius pastatė Pranas Janulevičius. Ant sienų kabo 1895 m. įsigyti Kryžiaus kelio stočių paveikslai. Šventorius aptvertas akmenų mūro tvora. Prie jos 1878 m. pastatyta medinė trijų tarpsnių varpinė, kurioje kabo du varpai su įrašais lotynų kalba. Upytės šv. Karolio Baromėjaus bažnyčiairUpytės Šv. Karolio Baromėjaus bažnyčios statinių kompleksas yra įtraukti į Nekilnojamojo kultūros paveldo registrą.

Iki 1595 m. Upytėje pastatyta evangelikų reformatų bažnyčia. Ji sunyko po 1665 m., mirus paskutiniam Sicinskių giminės palikuoniui. Upytės katalikų koplyčiai 1742 m. paskelbti atlaidai. Nuo 1849 m. rašytos metrikų knygos. 1927 m. stogas apdengtas skarda. 1937 m. nudažytas bažnyčios vidus ir išorė. 2007 m. restauruotas bažnyčios vidus, o 2013 m. atnaujinta išorė.