Balninkų parapija ne visada turėjo maldos namus – juos naikino karai ir gaisrai. Dabartinė Balninkų bažnyčia baigta statyti 1910 m. kun. Adomui Jusiui klebonaujant. Ją, 1921 m., Šv. Stanislovo titulu konsekravo Žemaičių vyskupas Pranciškus Karevičius. Tai dvibokštė mūrinė neoromaninio-neogotikinio stiliaus šventovė. Bažnyčios interjeras gotiškai suskliaustas ir padalintas į tris navas. Bažnyčioje esanti Nazariečio medinė skulptūra įtraukta į kultūros paminklų sąrašą ir saugoma valstybės.