Jakiškių kapinių koplyčia atspindi medinę liaudišką Joniškio krašto sakralinę architektūrą, išsaugojusią archajiškų bruožų ir įtraukta į Lietuvos medinės architektūros lobyną. Archajišką trobesį primenanti koplyčia unikali aukštu malksnomis dengtu valminiu stogu, kryžiumi puoštu bokšteliu, įspūdingos puošybos arkiniais langais bei arkinėmis dvivėrėmis durimis. Šalia jų dunkso dubeniuotasis akmuo – vandeninė, liudijantis krikščioniškos ir pagoniškos kultūrų sampyną. Ištakos siejamos su XVII a., kai Joniškio krašte veikė jėzuitų misijos, todėl jai ir suteiktas šio jėzuitų ordino įkūrėjo vardas.