Bažnyčios pastatas suprojektuotas vieno aukšto navos dalyje ir dviejų aukštų kitų patalpų ir koplyčios dalyje. Pastato išplanavimas toks, kad pagal pastato aukštį kinta erdvė. Bažnyčios navos didžiausias aukštis yra altorinėje dalyje ir yra 15,25 m. Prieangio ir tarnybinių patalpų 1 a. aukštis 3,25 m. Koplyčios aukštis sužemintas, įrengiant perdangą ir nedidelį balkoną. Kauno palaimintojo Jurgio Matulaičio parapija įkurta Kauno arkivyskupo Sigito Tamkevičiaus Dekretu 1996 m.