Šaukėnų dvaro sodyba žinoma nuo XVII a., tačiau dabartinė dvaro sodyba kūrėsi XIX a. pab. - XX a. pr. Spėjama, kad tai buvo Šonų giminės rezidencija. Vėliau Šaukėnai priklausė Šemetoms ir Gorskiams. Paskutinis dvaro valdytojas - Tomas Gorskis (1865-1940), gyvenęs čia iki Pirmojo pasaulinio karo pradžios. Tarpukario Lietuvos žemės reformos metu Šaukėnų dvaras išparceliuotas. Dvaro rūmai statyti XIX a., medinė dalis - neišlikusi. XX a. II p. rūmuose įsteigta Šaukėnų psichiatrijos ligoninė, kuri veikia iki šiol.