Seniausias Vaidotų istorinis pastatas yra Šv. Apaštalo Pauliaus Atsivertimo bažnyčia. Anksčiau ji buvo vadinama Baltosios Vokės Šv. Apaštalo Pauliaus Atsivertimo parapijos bažnyčia. 1813 m. Vilniaus Šv. Stepono parapijos klebonas Vaidotų kaime, Vokės kairiajame krante, pastatė koplyčią. Manoma, kad 1905 m. buvo patvirtintas architekto Tadeušo Rostvorovskio parengtas bažnyčios projektas. Dabartinė mūrinė bažnyčia pastatyta 1910 m. grafų Hilarijaus ir Vladimiro Lenskių iniciatyva. Bažnyčia turėjo įamžinti 1913 m. sukankančias Romos imperatoriaus Konstantino Didžiojo suteiktos krikščionybės išpažinimo laisvės 1600-ąsias metines. Bažnyčia neobarokinė, kryžminio plano, bebokštė, 3 navų. 2010 m., minint bažnyčios 100-ąsias metines, buvo pašventintas naujas altorius.

Prie įėjimo į bažnyčią yra atminimo lenta, skelbianti apie tragišką bažnyčios statytojų Lenskių šeimos likimą. Atminimo lentos iniciatorė – Kanadoje gyvenanti Lenskių giminaitė. Nuo 1949 m. Vaidotų bažnyčioje klebonavo ir prieglobstį rado kunigas, ikikarinės Vilniaus karaliaus Žygimanto Augusto gimnazijos prefektas Leopoldas Chomskis (1885–1982), poeto, būsimojo Nobelio premijos laureato, Česlovo Milošo, mokytojas. Vėliau poetas dedikavo jam du eilėraščius, kurie spausdinami knygoje "Gimtoji Europa". Kunigo pastangomis bažnyčia buvo atnaujinta. L. Chomskis palaidotas Vaidotų bažnyčios šventoriuje. Bažnyčios šventoriuje stovi plieno strypų varpinė.