Metelių regioninio parko centrinėje dalyje tyvuliuoja trys didieji Dzūkijos ežerai: Dusia, Metelys ir Obelija. Dėl smėlėtų ir plačių atabradų Dusios ir Metelio pakrantes pamėgo poilsiautojai. Rudenį ežeruose apsistoja gausūs migruojančių paukščių pulkai. Didelę reljefo formų įvairovę suformavo ledynai. Nuo kalvų ir piliakalnių viršūnių atsiveria kerintys kraštovaizdžiai. Nedidelėse tarp kalvų tyvuliuojančiose kūdrose ir pelkėse gyvena ir veisiasi ypač reti, visoje Europoje saugomi baliniai vėžliai.

Aukščiausioje parko vietoje ošia Trako miškas. Tai vienintelė Lietuvos vieta, kurioje natūraliai auga bekočio ąžuolo giraitės. Šių ąžuolų kamienai yra aukštesni ir laibesni, o gilių kepurėlės tvirtinasi prie šakutės be jokio kotelio.